在《军师联盟》中，曹丕跟司马懿之间的情愫难以说清，而不少人也认为他们君臣之间有一份特殊的际遇。
在曹丕还不是太子时，就有所谓“四友”：陈群、司马懿、吴质、朱铄，曹丕与四人的交情远过普通君臣，达到祸福与共的程度。
曹丕登帝位，不忘旧情。四友均蒙大用。但吴质和朱铄限于出身、事功，终究没办法达到陈群与司马懿的地位。抚今追昔，曹丕崩殂，司马懿心中当另有一番滋味。
在曹丕与曹植争位时，司马懿是曹丕四友集团中的一员，曹丕对他相当的信任。曹操怀疑司马懿有不臣之心时，曹丕力保司马懿，最后曹操说司马懿日后“必预汝家事”但也放过了他。
这一段晋书有过记载，“魏武察帝有雄豪志，闻有狼顾相，欲验之。乃召使前行，令反顾，面正向后而身不动。又尝梦三马同食一槽，甚恶焉。因谓太子丕曰：‘司马懿非人臣也，必预汝家事。’太子素与帝善，每相全佑，故免。帝于是勤于吏职，夜以忘寝，至于刍牧之间，悉皆临履，由是魏武意遂安。”
黄初三年、五年，曹丕伐吴的时候，命司马懿留守许昌。黄初六年曹丕攻吴，仍命司马懿留守，并在给司马懿的诏书中将他比作萧何。
黄初六年，司马懿转任抚军大将军、假节，领兵五千，加给事中、录尚书事。司马懿一开始辞让，曹丕对他说：“吾于庶事，以夜继昼，无须臾宁息。此非以为荣，乃分忧耳”。
曹丕临终托孤时，司马懿是四大辅臣之一。司马懿在曹丕死后，曹睿在位时权力达到顶峰，但他那时对曹睿也算的上忠心。往后高平陵事件既不是曹丕能预料到的，恐怕也不是与曹丕相处时的那个司马懿能料到的。
与电视剧里不同，应曹操征辟之前，司马懿和曹丕应无交往。尽管司马家和曹家确实有点渊源。
曹操青年时任洛阳北部尉，出于司马懿之父司马防的举荐，东汉末年也的确有所谓二重君臣制。
但这并不是说，以后曹操就得永生奉司马防为主为君，对其恭敬无二，乃至即便司马防参与衣带诏，曹操也不能拷掠之。
